Cửa biển Sa Kỳ nằm ở phía đông bắc tỉnh Quảng Ngãi, giữa hai xã Bình Châu (H.Bình Sơn) và Tịnh Kỳ (TP.Quảng Ngãi), nơi sông Châu Me và sông Chợ Mới đổ về. Đây là cửa biển dong thuyền ra đảo Lý Sơn (cù lao Ré) gần nhất so với các cửa khác dọc bờ biển VN.